Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms