Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPIBQ01892 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPIBQ01892 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms