Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POU5F1Q01860 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms