Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN7AQ01118 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN7AQ01118 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms