Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSG6Q00889 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms