Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL23P62829 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL23P62829 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms