Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTA2P62736 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA2P62736 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms