Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.4 ms