Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms