Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EEFSECP57772 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms