Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK4P57078 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK4P57078 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms