Protein–RNA interactions for Protein: P56277

CMC4, Cx9C motif-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC4P56277 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMC4P56277 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC4P56277 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC4P56277 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC4P56277 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms