Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTEP56180 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTEP56180 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTEP56180 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTEP56180 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TPTEP56180 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TPTEP56180 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TPTEP56180 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTEP56180 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTEP56180 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTEP56180 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTEP56180 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTEP56180 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTEP56180 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTEP56180 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TPTEP56180 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms