Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH8P55286 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH8P55286 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH8P55286 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH8P55286 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH8P55286 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH8P55286 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH8P55286 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms