Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP7P55210 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP7P55210 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP7P55210 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP7P55210 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP7P55210 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP7P55210 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP7P55210 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP7P55210 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASP7P55210 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP7P55210 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP7P55210 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms