Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFDNP55196 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFDNP55196 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AFDNP55196 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFDNP55196 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFDNP55196 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFDNP55196 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFDNP55196 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFDNP55196 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFDNP55196 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFDNP55196 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFDNP55196 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFDNP55196 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFDNP55196 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AFDNP55196 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFDNP55196 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFDNP55196 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFDNP55196 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFDNP55196 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AFDNP55196 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFDNP55196 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFDNP55196 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFDNP55196 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFDNP55196 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AFDNP55196 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFDNP55196 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFDNP55196 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFDNP55196 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFDNP55196 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFDNP55196 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFDNP55196 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFDNP55196 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFDNP55196 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms