Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP1B3P54709 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP1B3P54709 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms