Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA8P53708 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA8P53708 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms