Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFIP1P53367 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARFIP1P53367 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms