Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP98P52948 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP98P52948 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP98P52948 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP98P52948 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP98P52948 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP98P52948 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP98P52948 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP98P52948 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP98P52948 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP98P52948 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP98P52948 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP98P52948 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP98P52948 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP98P52948 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP98P52948 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP98P52948 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms