Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCN3P51790 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCN3P51790 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms