Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRCA2P51587 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms