Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAPOLAP51003 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PAPOLAP51003 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAPOLAP51003 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAPOLAP51003 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAPOLAP51003 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAPOLAP51003 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAPOLAP51003 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAPOLAP51003 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLAP51003 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLAP51003 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLAP51003 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLAP51003 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAPOLAP51003 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms