Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK7P50613 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK7P50613 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK7P50613 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK7P50613 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK7P50613 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK7P50613 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms