Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSRP3P50461 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSRP3P50461 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms