Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSEN2P49810 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSEN2P49810 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms