Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX1P48742 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX1P48742 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX1P48742 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX1P48742 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX1P48742 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX1P48742 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX1P48742 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX1P48742 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX1P48742 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX1P48742 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms