Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NESP48681 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NESP48681 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NESP48681 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
NESP48681 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
NESP48681 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NESP48681 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NESP48681 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NESP48681 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NESP48681 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NESP48681 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NESP48681 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NESP48681 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NESP48681 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NESP48681 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NESP48681 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NESP48681 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NESP48681 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NESP48681 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NESP48681 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NESP48681 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NESP48681 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NESP48681 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NESP48681 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NESP48681 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NESP48681 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NESP48681 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NESP48681 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NESP48681 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NESP48681 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NESP48681 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NESP48681 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NESP48681 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NESP48681 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NESP48681 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NESP48681 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NESP48681 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NESP48681 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NESP48681 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NESP48681 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
NESP48681 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NESP48681 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms