Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4P46934 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms