Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPL28P46779 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPL28P46779 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPL28P46779 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPL28P46779 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPL28P46779 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPL28P46779 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPL28P46779 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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