Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR4A2P43354 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR4A2P43354 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms