Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX1P40424 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX1P40424 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX1P40424 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX1P40424 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX1P40424 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX1P40424 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX1P40424 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX1P40424 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX1P40424 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX1P40424 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX1P40424 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX1P40424 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX1P40424 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX1P40424 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms