Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFTPDP35247 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms