Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BMI1P35226 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMI1P35226 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMI1P35226 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMI1P35226 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMI1P35226 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMI1P35226 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMI1P35226 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms