Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPC1P35052 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPC1P35052 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPC1P35052 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GPC1P35052 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms