Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GBP1P32455 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBP1P32455 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms