Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBEC3AP31941 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms