Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA11P31270 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms