Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP1P29466 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP1P29466 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms