Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTKP29376 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTKP29376 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTKP29376 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTKP29376 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LTKP29376 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTKP29376 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTKP29376 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTKP29376 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTKP29376 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTKP29376 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTKP29376 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LTKP29376 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LTKP29376 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LTKP29376 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTKP29376 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTKP29376 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTKP29376 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTKP29376 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTKP29376 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTKP29376 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTKP29376 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTKP29376 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTKP29376 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTKP29376 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTKP29376 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTKP29376 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTKP29376 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTKP29376 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTKP29376 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms