Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRB3P28472 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms