Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PSMB4P28070 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB4P28070 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms