Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4AP27815 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4AP27815 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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