Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSSP25774 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTSSP25774 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSSP25774 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSSP25774 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSSP25774 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms