Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms