Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms