Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRBP23467 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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