Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms