Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD1P21695 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD1P21695 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPD1P21695 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPD1P21695 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPD1P21695 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPD1P21695 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPD1P21695 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms