Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP4AP20648 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms